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SN 中华人民共和国出入境检验检疫行业标准 SN/T 2343—2009 菜豆荚斑驳病毒检疫鉴定方法 Quarantine identification of bean pod mottle virus 行业标准信息服务平台 2009-07-07发布 2010-01-16实施 中华人民共和国 发布 国家质量监督检验检疫总局 SN/T23432009 前 言 本标准的附录B、附录C、附录D为规范性附录,附录A为资料性附录 本标准由国家认证认可监督管理委员会提出并归口。 本标准起草单位:中华人民共和国厦门出入境检验检疫局、中华人民共和国福建出人境检验检疫 局、中华人民共和国深圳出人境检验检疫局 本标准主要起草人:廖富荣、陈青、沈建国、郑耘、林石明、陈红运、郭琼霞、黄蓬英、王宏毅、吴媛, 游源浅、虞。 本标准系首次发布的出人境检验检疫行业标准。 行业标准信息服务平台 SN/T2343—2009 菜豆荚斑驳病毒检疫鉴定方法 1范围 本标准规定了菜豆英斑驳病毒检疫鉴定的程序和方法。 本标准适用于可能携带菜豆荚斑驳病毒的大豆、菜豆等种子、苗木等植物繁殖材料的检疫鉴定,也 适用于介体昆虫中该病毒的检疫鉴定。 2原理 2.1分类地位 菜豆荚斑驳病毒(Beanpodmottlevirus)属于豇豆花叶病毒科(Comoviridae)、豇豆花叶病毒属 (Comovirus)的成员。可以分为亚组I和亚组Ⅱ两个亚组。相关资料参见附录A。 英文缩写:BPMV 2.2血清学特性 BPMV具有很强的免疫原性,制备的多克隆抗体可以检测大豆叶片、种子、草本寄主植物和介体昆 虫中的病毒。 2.3分子生物学特性 BPMV是一种正链RNA病毒,其基因组由两条正链RNA-1(约3.6kb)和RNA-2(约6.0kb)组 成,分别包裹在两个直径为28nm的等轴多面体粒体中。RNA-1编码5个复制所需的蛋白,RNA-2编 码一个推导的细胞间运动蛋白和两个外壳蛋白。根据其基因组序列可以设计用于分子检测的特异性引 物和探针,用来该病毒的特异性检测。 BPMV所在的豇豆花叶病毒属的种划分标准是: a)大外壳蛋白(Coatprotein,CP)的氨基酸序列同源性小于75%; 聚合蛋白酶的氨基酸序列同源性小于75%; ) 在可能的成分间没有假重组; 业标准信息服务平台 d) 抗原反应有差异。 3 主要仪器设备与试剂 3.1 主要仪器设备和用具 微量研磨仪; 酶标仪; 洗板机; 微量天平(感量:0.001g); -PCR仪; 电泳仪; 一水平电泳槽; 凝胶成像仪; 高速冷冻台式离心机; 一 水浴槽; pH计; 各种量程的可调移液器(1000μL、200μL、20μL、2μL); SN/T2343—2009 各种吸头(1000μL、200μL、20μL、2μL); —96孔酶标板; 离心管(1.5 mL、0.6 mL、0.2 mL)。 3.2主要试剂 主要试剂和缓冲液见附录B和附录C。 4检测样品的制备 4.1检测样品 将送检样品制备为血清学或分子生物学检测鉴定的检测分样品。对每批送检样品进行症状检查, 挑选具有褐色或黑色斑驳症状的种子(从种脐开始),或者选取具有斑驳、皱缩、褪绿等症状的叶片。 4.2DAS-ELISA和IC-RT-PCR检测样品的制备 种子样品:选取一定量的种皮作为检测分样品(如0.5g~1.0g),在液氮中充分研磨,回温后按比 例加人样品提取缓冲液继续研磨[通常1:(5~10)]。 叶片样品:选取一定量的叶片作为检测分样品(如0.5g~1.0g),在液氮中充分研磨,回温后按比 例加人样品提取缓冲液继续研磨(通常1:10)。 把研磨后的样品转移到5mL离心管中,8000r/min离心5min,上清液作为DAS-ELISA和IC RT-PCR检测提取液。 注:提取液在3h内使用,否则保存在4℃中。 4.3RT-PCR检测样品的制备 称取表现症状的0.1g叶片、种子等样品在液氮中充分研磨后,提取RNA。 5检测与鉴定 5.1DAS-ELISA检测 DAS-ELISA检测应设置对照,用健康的植物组织作阴性对照,用感染BPMV的植物组织作阳性对 照,用样品提取缓冲液作空白对照。其中,阴性对照的种类和材料(如种子或叶片)应该尽量与所检测样 品相一致。 具体操作过程见附录B。当使用商业性检测试剂盒时,参照试剂盒说明进行操作。 5.2RT-PCR检测 RT-PCR检测应设置对照,用健康的植物组织作阴性对照,用感染BPMV的植物组织作阳性对照, 用ddH20作空白对照。 具体操作过程见附录C。 5.3IC-RT-PCR检测 IC-RT-PCR检测应设置对照,用健康的植物组织作阴性对照,用感染BPMV的植物组织作阳性对 照,用ddH2O作空白对照。 具体操作过程见附录D。 5.4序列测定 将PCR产物回收后,进行克隆、测序,或者直接测序,测序可由生物公司完成。把测序所得到的核 苷酸序列与已知的BPMV相应序列进行比对,如果与已知的BPMV相应序列相一致则判定为BPMV, 不一致则判定为非BPMV。 6结果判定与记录 6.1结果判定 当DAS-ELISA检测结果呈阳性、同时IC-RT-PCR或RT-PCR检测结果呈阳性时,则判定为 检出BPMV; 2
SN-T 2343-2009 菜豆荚斑驳病毒检疫鉴定方法
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